最近发表在《分子生物学与进化》杂志上的一篇新文章发现,病毒载量较高的人病毒重组率也较高。 事实上,血液中的HIV越多,病毒就越容易多样化。
HIV历来难以抗击的原因之一是该病毒具有极高的重组率。 重组使病毒株之间的遗传信息交换成为可能,并促进了HIV在人类中的进化。 这种基因交换导致病毒逃避免疫系统,并对许多旨在**HIV的药物产生抗药性。
更一般地说,重组是一个重要的进化驱动力,它允许生物体清除破坏性突变并结合有益的突变。 但科学家们还不知道HIV的重组率在整个感染过程中或不同人之间是如何变化的。 了解在经过充分研究的系统中影响重组率的因素,如HIV,可以帮助更广泛地揭示重组对进化的一些影响。
HIV重组中一个重要但未被充分研究的步骤是合并感染,其中两个不同的病毒颗粒感染同一细胞。 尽管长期以来对HIV重组感兴趣,但科学家们尚不清楚合并感染率的变化是否会导致重组率的变化。 虽然对细胞培养物和小鼠中HIV的研究表明,合并感染的增加与重组病毒的增加有关,但目前尚不清楚是否在HIV感染者中发现了这种影响。
参与这项研究的研究人员假设,病毒载量较高(血液中HIV含量较高)的人会同时感染更多的细胞,这将导致病毒的重组率更高。 为了研究这一假设,科学家们开发了一种称为时间序列连锁衰减重组分析(RATS-LD)的新方法,以使用突变随时间推移的遗传关联来量化重组。
该研究发现,虽然数据集底部三分之一的病毒载量HIV人群的重组率与先前的估计一致,但是,病毒载量在前三分之一的人群中,重组率的中位数高出近六倍。此外,研究人员还观察到单个个体的病毒载量和有效重组率同时增加的模式。
这些结果表明,HIV重组的发生率可能比研究人员先前认识到的还要极端。 除HIV外,许多生物体,如细菌和植物,不需要重组即可繁殖,但可以从中受益。 为了交换遗传物质,这些生物还依赖于两个不同的基因组在同一地点和时间相遇。 此外,研究结果表明,种群密度可能影响重组在多种环境中的有效性。
科学家表示,重组率可能取决于环境,并受到许多不同分子因素的影响,而种群密度可能是以前被低估的病毒因素之一。
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