大业十三年四月，前隋晋城队长薛举和儿子薛仁国杀了晋城岭，正式举兵攻打隋，自称西秦霸主。 随后，一路如竹，先后攻占了曹汉、西平、斗河等地，占领了龙溪，拥有十三万大军。 然后，他占领了天水，自称秦帝，并将首都迁至天水。 11月，自称秦始皇的薛举击败了自称楚国皇帝的李洪志和自称唐王的唐璧，并吞并了他们的部下顿时，薛巨的声音一惊，实力大增，号称拥有三十万大军。 此时，薛炬成为李渊在世界上最具威胁性的分裂势力之一。
十二月初，薛举命长子薛仁高率领十万大军攻打阜丰，准备与李渊争夺关中。 李渊立即下调，部队分成两条路：一条路线由李世民率领，进攻约仁国; 一条路线由江墨和窦良率领，从三观出发，进攻薛居的基地龙游。 李渊在对付薛菊的同时，命令李孝公率军渡过秦岭，准备攻占巴蜀地区。
12月17日，李世民率军前往阜丰，年轻轻浮的薛仁国是军事天才李世民的对手，不久后，李世民在阜丰击溃了薛仁国的军队，歼灭了他们一万多人，一路追击薛仁国到龙山附近。
薛巨听到儿子战败的消息，心里一惊，他并不担心儿子的死活，而是怕李世民越过龙山来攻打他，于是连忙问手下：“自古以来，皇帝就投降了吗？ ”
听完薛菊的话，时任魏维清的郝明连忙上前，大声说道：“陛下不该有这种想法，汉朝老祖刘邦经历过无数次失败，刘备连妻儿都没有保护好，他们都不是都大功成名，陛下怎么会因为一个小小的失败就打算死。 ”
薛炬觉得无语，尴尬的笑了笑，说道：“我只是试探你的态度，没有别的打算。 然后他重金赏金郝莹，让他成为知己。
12月下旬，李渊派去攻打薛居根据地的江墨、窦铁抵达长岛结果，他遭到了薛巨的伏击，战败归来，不得不撤退到长安。 至此，薛炬成为了与李渊一战中最强大的势力。
眼看着唐朝的壮大，薛炬越发不安。 武德元年四月，他派使者前往突厥，要求他联合攻打唐朝，但被结礼汗拒绝。
武德元年5月20日，五十三岁的唐王李渊在太极殿登基称帝，建立了唐朝。 与此同时，李孝公攻占巴蜀地区后，唐朝的势力范围已经超过了任何一个分裂势力当时的情况是——北方有刘梧州，但他远在马一，在太原被李元济监视，所以对长安没有太大的威胁; 朔方梁世都准备与突厥人联合入侵关中，但在唐朝的拉拢下，突厥人已经与唐朝交上了朋友，梁世都的目标难以实现; 武为李氏，在唐朝的拉拢和绥靖下，也选择了中立。 所以，对于李渊来说，对关忠最大的威胁就是龙游的薛炬集团，成为了李渊最强的对手。
正月初十，薛举率大军攻打唐朝荆州，正式向唐朝发起挑战。 但此时唐朝已经发展到足以应对任何威胁。 于是，当上了皇帝的李渊，决定彻底消灭薛巨集团，消除眼前的危险。
随后，李渊以李世民为元帅，率领八位总督去见薛举。 七月初，李世民率军攻打高奇城，同时薛炬也亲自率领大军攻打高奇，先头小兵已经到达了丰州、祁州一带，来势汹汹。
但就在关键时刻，唐军元帅李世民染上了疟疾。 没办法，李世民只好命令大军挖深壕，封闭城防，不战而屈人之兵，同时将军队指挥权交给刘文景和尹开山并警告他们：“薛居孤军，深入我们腹地，时间长了，粮食缺草，士兵们会累了。 所以，一旦他来挑战，你就千万不要打，等我好了，我们再商量攻打薛菊。 ”
“养粮累兵，把军队挂得很深，本来是决战，不利于持久。 如果你想挑战，你会谨慎和犹豫不决“，”我会从我的疾病中恢复过来，然后试着打破它”。然而，刘文静和尹开山并没有听从李世民的警告。
刚走出李世民的大帐篷，尹开山就对刘文景说：“薛巨听说王爷病了，一定要掉以轻心，咱们应该趁机攻打薛巨。 刘文静听从了尹开山的建议。
于是，他立即率军在高邞西南的浅水源处列阵，准备与薛炬作战。 而这边薛炬听到唐军在打仗，高兴得差点跳起来，他最怕的就是唐军不出来，这个刘文景却被送到了门口他一边排兵布阵，一边迎头糊弄唐军，一边派骑兵绕着唐军的后方走，准备对唐军发动突然袭击。
武德元年七月初九，双方在浅水源地激战，刘文静败下阵来。 唐军八大统帅全部战败，大半兵阵亡，将领刘洪基、李安元等人全部被俘。 有鉴于此，李世民只好率军撤退到长安。 而薛举则趁势占据了高颚，将唐军的尸体堆成一堆，以炫耀自己的军力。
关于浅水源的失败，史上记载李世民患疟疾，将军权交给刘文景指挥。 这或许是真的，但也有可能是李世民败的幌子。 试想一下，刘文景的兵力部署如此之大，李世民怎么可能不提前知道消息，让刘文景调兵攻薛居。 但无论如何，失败就是失败。 浅水源之战的失败，也是李渊自举军以来遭受的第一次惨败。 而作为罪魁祸首的刘文静和尹开山，依然不可饶恕。 回到长安后，两人立刻被李渊解雇，等着他们被解雇。
浅水源的失败，给李唐朝带来了沉重的打击，同时，李渊也越来越觉得，如果薛炬不死，他就永远吃不睡好觉。 但好在，也许是上天眷顾了乱世崛起的唐朝，就在薛举准备用浅水之力攻打长安的时候，他自己却病死了。
薛举死后，由其子薛仁国继位。 薛仁国继位后，原本攻打长安的计划不得不停止。 听到薛仁国的死讯，李渊笑了笑，因为他知道，对唐朝的重大威胁已经消失了与他的老子薛菊相比，薛仁国在勇气和力量上都略逊一筹。 所以，这个时候，他没有什么可担心的。
武德元年九月，李渊再次以李世民为元帅，率军攻打上次失守的高旗城。 这一次，李世民吸取了上次失败的教训，当军队到达高齐时，李世民命令士兵们不要私下去打仗。 薛仁国派将领宗洛虎出城挑战，李世民只是关上城门，不肯出战。
看着宗洛虎嚣张跋扈的样子，李世民能忍，可是手下士兵忍不了，纷纷要求开战。 但李世民说：“我军刚战败，士气低落，盗贼得胜，有心鄙视我，不如关闭基地等。 他为我感到骄傲，他会在战斗中战胜它。 “一句话，对方再怎么挑战，我们都不能出去打仗，等他们大军嚣张，我军士气高涨的时候，就能一战打败他们。
李世民怕士兵们像上次那样私下打仗，于是向军队发号施令“敢说话，斩！””
一方面是薛仁国想引诱唐军出战，另一方面李世民不肯打，双方对峙了60多天过了许久，薛军中终于有人受不了了，以梁虎浪为首的将领们率兵向唐军投降。
李世民知道，此时的秦军已经分开了，现在是进攻薛菊的最佳时机。 上是的，他命令梁氏将他的军队单独部署在浅水源中，以引诱敌人参战。 宗洛虎一战，率领众精锐，向梁氏发起了猛烈的进攻。 梁石顶住险阻，顽强抵抗，在营地缺水、连日人马缺困的困境下，一次又一次顽强地抵挡住了宗洛虎的进攻。
经过几天的激战，李世民预料到此时的薛军已经到了极限，于是下达了总攻的命令，亲自率领浅水源北面的主力部队，出其不意地向薛军的后方发起攻击。 他率先率领十几骑兵冲进敌阵，大军紧随其后，展开猛烈进攻，薛军败逃而逃。
李世民见状，亲自率领两千骑兵准备追击。 但他的舅舅窦亮却说：“薛仁国还在守城，我军虽然已经破门，但前进肯定不容易，请你站着不动，等着看会发生什么。 ”
不过，李世民认为这是追击胜利的好机会，不给敌人喘息的机会，于是率领大军追击宗洛虎，一路追到高颚城脚下。 薛仁国急忙出城列阵，准备迎击唐军。 两军交战，薛仁国见唐军攻势猛烈，便退到城中。 唐军继续发动猛攻，薛军士气低落，出城投降。
十一月初八，心灰意冷的薛仁国见大势已去，便率领剩余部队向李世民投降。 李世民接待了薛仁国的1万多名精锐士兵和5万多名高旗市男女居民。
11月22日，李世民小队返回长安，在市区斩杀了薛仁国，这算是为第一次浅水之战牺牲的唐军士兵报仇。
至此，在龙溪的薛炬父子彻底退出了霸道舞台。 从建军到战败，只持续了一年零七个月。
第二次浅水源之战的胜利，使龙溪地区全部归唐朝所有，不仅巩固了关中，也扩大了唐朝的势力范围，消除了后顾之忧。 也是从这个时候开始，李世民杰出的军事才能逐渐开始在世人面前展现出来。 没有人会怀疑，假以时日，这位年轻的二皇子，一定会成为唐帝国最杰出的统帅。 在很长一段时间里，他都会成为李渊赢得世界的王牌，帮助李渊一次次化解危机。