靶蛋白的定量MRM分析是指基于质谱的多反应监测（MRM）。 该技术本质上是一种质谱扫描模式，基于目标蛋白的特定母离子和子离子对，选择性地采集符合目标离子规则的信号，去除不符合规则的信号干扰，进行高灵敏度、准确、特异性的靶向蛋白质定量。 MRM质谱分析主要包括三个阶段：（1）初级质谱扫描，筛选出与目标分子特异性一致的母离子;（2）母离子碰撞碎裂，去除干扰离子;（3） 仅从选定的特定离子中获取质谱信号。 母离子通道可以根据理论**或实际实验结果进行选择。
平行反应监测 （PRM） 是 MRM 的衍生物，也可用于同时或绝对定量复杂生物样品中的多种目标蛋白质。 PRM采集目标肽的高分辨率MS2质谱图，利用软件提取ppm级目标离子的峰面积，有效排除其他离子的干扰。 与MRM相比，具有更宽的动态范围、更高的精度、更强的灵敏度、更好的重复性、更强的抗背景干扰能力、更简单的实际操作和更低的成本。 PRM不需要基于目标蛋白的母离子和子离子配对，从而能够对子离子进行全面扫描。 PRM 可用作蛋白质印迹技术的替代方案，以高通量验证大量生物样品中的抗体，并可应用于各种非模式生物。
PRM由五个主要实验程序组成：（1）从鸟枪实验或理论推测中选择目标肽（2）制备样品混合物;（3）参数和靶肽的实验前调整;（4）PRM检测;（5）数据分析。 PRM方法的缺点是，当待分析的肽数过多时，需要对质谱采集参数进行微调，否则会大大影响定量数据的准确性和精密度。
图PRM实验流程图。
客户**订单-订单 实验材料确认 - 蛋白水解 - DDA模式库构建 - 通用库优化 - 数据收集 - 数据分析 - 交付结果。
我们的优势
1.与其他类型的样品相比，植物样品很容易获得。
2.从样品制备、机载测试、实验报告到专业的售后服务，我们提供一站式蛋白质组学服务。
3.使用先进的质谱仪提供高灵敏度、高通量的分析，以确保高质量的数据。
4.可以对客户感兴趣的蛋白质进行靶向验证实验。
适用场景
1、大规模蛋白质组检测后靶蛋白的验证;
2、同源蛋白或突变蛋白的定量研究;
3、无标记等非靶向蛋白质组研究成果的验证;
4、同时对多种蛋白质肽进行绝对定量研究
5.研究同源性高但缺乏特异性识别抗体的蛋白家族的变化
6. 蛋白质翻译后修饰的定量研究;
7、生物病害靶点的绝对定量研究;
8.开发临床诊断试剂盒。
实验周期
自样品交付之日起 30 个工作日。
样品验收标准
客户订单并填写项目信息
如需注册或登录我们的官网，请填写项目名称，选择项目类型，根据页面提示填写个人信息及提交项目所需的具体信息，包括：
1、样品**、内容、状态等基本信息;
2、尽可能丰富相关资料和文献。
实验信息
在实验过程中，客户可以随时登录管理系统，查看项目的实时进度。 实验完成后，系统会自动通过短信通知客户，并发送实验报告查看**。 实验完成后，实验报告和测试结果可以查看或打印，并永久保留。
实验性可交付成果
1、分析报告：包括实验过程、仪器型号、参数、试剂耗材、定量结果统计等
2、定量结果文件：一般excel**;
3.质谱原始文件：PRM收集的优化光谱库和WIFF格式的原始数据。
一个经典案例
发表期刊： Bioresource Technology
影响因子： 114
出版年份：202009
1. 背景。
虾青素是一种叶黄素类胡萝卜素，呈红色，已应用于食品、化妆品等多个行业，应用前景广阔。 天然虾青素的先进途径之一是红斑红褐藻，当外界条件不利时，虾青素的产生会增加，但现有数据不能完全解释红曲合成虾青素的胁迫响应机制。 先前的实验结果表明，500 mg ml TiO2可以显着增加虾青素等类胡萝卜素的产生。 基于这些结果，本研究分析了TiO2对虾青素产生的影响，以及胁迫条件促进红酵母合成虾青素的分子机制。
2.实验方法。
作者以野生型红法夫酵母PR106为研究对象，在Yepd培养基中培养有或不有500 mg ml TiO2的酵母细胞至中期，以500 mg ml TiO2培养的菌株C1、C2、C3为对照组，不用500 mg ml TiO2培养的菌株S1、S2、S3为实验组， 提取总蛋白，用TMT化学试剂标记，等待质谱检测。结合质谱数据，选取红酵母菌中期15个差异表达蛋白，采用PRM靶向定量蛋白质组学进行质谱分析。
3.实验结果。
本研究共定量了3193个红叶芨差异表达蛋白，其中5个蛋白表达量上调，56个蛋白表达量下调。上调的蛋白主要定位于质膜、细胞核或细胞外，下调的蛋白主要定位于细胞核、线粒体、质膜、细胞质和细胞外。 GO和KEGG富集分析结果显示，差异表达蛋白主要与非膜结合剂和膜的整体组成有关，主要富集在RNA降解途径中，且几乎全部下调。 经PRM靶向蛋白质组学验证的15种差异表达蛋白结果显示，500 mg mL TiO2可显著促进酵母中期虾青素的合成。
图1 差异表达蛋白的火山图。
图2 TiO2胁迫下基于GO和GGG的红曲差异表达蛋白功能富集分析。