元代，灵隐寺虽然衰落，但飞来峰上的石刻绽放出耀眼的光彩，达到了顶峰。 第99洞，位于胡猿洞附近，是元代石刻的代表，中间是无量寿佛，两侧是文殊菩萨和青度母，具有浓郁的藏传佛教组合特色。 此外，还有金刚手菩萨、三面八臂佛母等，显示了汉族和藏族佛像的区别。
其中，有一尊不能供奉的石像，他既不是佛也不是阿罗汉，而是妖僧杨炼振家，至元十四年（公元1277年），被任命为元朝江南石教**，负责江南佛教事务。 然而，他并没有献身于佛陀，在桑戈丞相的支持下，他肆无忌惮地挖掘了绍兴的钱塘和宋陵，并偷走了陵墓中的所有宝藏，而那些皇帝的骨头则被遗弃在荒草丛中。 他的恶行令人发指，令人发指。
从锄公塔出发，可以前往洞，又称蝙蝠洞和罗汉洞。 这里洞穴顶部岩石中的水滴类似于晶莹剔透的白色珍珠，因为水滴与乳白色石灰石溶液混合在一起。 相传，晋朝道士葛晓娴曾经在这里专心修炼，最后成为仙人，为这片土地增添了几分神秘和不朽。 踏入洞窟，可以看到北宋天圣四年（公元1026年）雕刻的十八尊罗汉佛像，旁边还有六位禅宗祖宗祖，分别是：一祖法、二祖慧可、三祖僧灿、四祖道信、五祖弘仁、 六祖慧能，统称为“极光六祖”。这些罗汉和六祖，栩栩如生，表情各异，仿佛在诉说着自己的传奇故事，散发着古代文化的韵味。
在洞口不远处，矗立着一棵藤树，它天生就被赋予了灵性，弯曲而伸展的树枝优雅地勾勒出心形的轮廓。 当人们站在那里拍照时，他们只是填写了“心”字的点，自然而然地形成了一个完美的心字，似乎是自然与人类的完美融合，传达着心与心的美好寓意。 成为网红打卡地，吸引无数游客前来拍照留念。
飞莱峰东南侧最大的洞穴被称为“青林洞”，也被称为“虎洞”或“金光洞”，因为洞口像虎嘴。 青林洞口上方的三尊佛像为“华严三圣”，中间的维鲁查那佛双手握拳，寓意佛光照众生; 两边是文殊菩萨和蒲贤菩萨，守护着佛法的庄严。 这座神龛佛像建于公元1282年，是元代最早的壁龛之一，具有极高的历史价值。 下面，是传说中的济公床，光滑如镜，宛如天地间的天然沙发，刚好能容纳一个人仰卧。 岩石上还刻有十八罗汉石刻，生动活泼。 相传，济公当年在灵隐寺当僧人，因为性格独特，经常不守寺规，夜深人静时回来，山门紧闭，仰卧在这里，与天地同眠。 石床对面，映入眼帘的是卢舍那佛的石刻，这是北宋乾行元年（公元1022年）的杰作。 每一刀、每一刻都透露着工匠的精湛技艺，结构严谨，形象生动，堪称宋代石雕艺术的瑰宝。
飞来峰龙虹洞，又名通天洞、观音洞，真是不容错过的奇观。 这个洞窟里有两尊观音像，一尊是人工雕刻的杰作，精致逼真; 另一种是大自然的馈赠，神奇而自然。 两者相辅相成，共同构成了龙虹洞难得一见的奇观，让人不禁赞叹不已。
洞外石刻上的经文，见证了历史的变迁。 它描绘了三个不同的经文学习时期：从汉明皇帝刘庄的《白马经》开始，到三国时期魏国高僧朱世兴前往于阗的旅程，最后是唐三藏到天竺学习经文的旅程。 这些栩栩如生的画面仿佛在诉说着古老的传说，唤起了心中美好的回忆。