崇祯皇帝朱友祯作为明朝的皇帝，他与历史上其他皇帝截然不同，崇祯在位18年，期间他勤奋勤劳，爱民。 然而，在他统治期间，天色并不好，在他统治的18年，9年旱灾，9年内涝，百姓苦不堪言，朝廷面对如此严重的天灾无能为力。 百姓再也忍受不了了，纷纷奋起反抗明朝，最后李自成突围京城，崇祯也在煤山上上吊自杀。 其实除了旱涝灾害，明朝还发生了一场巨大的瘟疫灾害，而这场瘟疫灾害也对明朝的走向产生了重大影响。
依靠现代科学的进步，我们知道，所谓的鼠疫，其实是一种由一种叫做“鼠疫耶尔森菌”的细菌引起的疾病，这种细菌原本存在于老鼠身上，但由于老鼠经常出没于人类的日常生活场所，老鼠身上的跳蚤可能成为这种细菌传播的跳板，从而进入人体， 而感染后，会引起腺鼠疫、肺鼠疫和败血性鼠疫等流行病，在当时的医疗条件下，基本上是无法治愈的。感染腺鼠疫的人的死亡率高达75%，感染肺鼠疫的人的死亡率接近惊人的100%。
一般来说，瘟疫是存在的，但爆发起来并不是那么简单。 明朝末年爆发如此巨大的瘟疫，其实很早就预示了。 早在万里时期，由于全球冰山活动，华北地区气候发生变化，全国范围内降雨不足，干旱频发。 仅在万历年间，就发生了三次大旱，其中死去的动物和尸体导致了瘟疫和疾病的传播。
同时，由于粮食产量大幅减少，许多人向北迁往一些原本是草原的地方开垦土地，但一些原本生活在北方草原的老鼠作为外来物种入侵了南方的田野，这些老鼠成倍增加。 然而，随后的旱灾不仅使人们挨饿，还导致大量老鼠四处逃窜寻找食物，甚至许多饥饿的无家可归者选择吃老鼠来充饥。 最终，瘟疫被触发，然后感染瘟疫的无家可归者到处旅行并传播细菌。
瘟疫先是在山西大同爆发，然后蔓延到山西的太原、忻州等地，很多人为了躲避瘟疫而选择逃亡，很多地方甚至成了空城，但这种做法反而加剧了瘟疫的蔓延，最后甚至蔓延到京城，据不完全统计， 明朝末年死于瘟疫的人数多达1000万人之多，首都北京近四分之一的人口死亡，而明朝灭亡的原因不仅是战争因素，瘟疫也是重要原因之一。