1045年春天，一个外行模样的中年人路过藏北的索曲卡，看见一个正在办丧事的富人，就走进院子恳求道：“我是赶事的人，想请点酒解渴。 屋主气势汹汹地说：“我，昌卡碧琼，不是普通人，你一定要给我磕头才能拿到酒。 中年男子躬身一礼，坐在一旁喝水的地上。
这时，禅卡碧琼滔滔不绝地谈论佛教，居士根本没有礼貌地反驳。 昌卡碧琼吃了一惊，他没想到这个寒酸的男人竟然有这么见多识广，于是用疑惑的语气问道：“我之前听说康区有个叫锺敦巴的居士，佛学高超，先生，不是您吗？ 那人说：“也许是吧！ 听到这话，他赶紧从座位上拿出一个垫子，放在卓姆敦巴的屁股下面，同时向喇嘛献上一匹带缎子挂脖的好马，请他无论如何都原谅自己的无知和粗鲁，然后提议在热仁建造一座寺院， 藏北，反正请君子来见住持。“我正要去阿里接阿底峡尊者，我现在不能答应你的请求。” 毕琼说，那以后请你做我的福天吧！
卓敦巴（1004-1064）是拉萨以西的斗龙人，因与继母不和而离家出走，到处找师师学佛法。 19岁那年，他来到康区拜奉师傅，勤勤恳恳地侍奉师尊近20年，从未停止过放牛、放马、磨面粉、柴火的工作。 在世尊面前，他全面研读了经籍和密经，尤其精通龙树菩萨和阿僧的著作，在康区非常有名。
卓敦巴长途跋涉来到阿里，与阿底透一起见，献上**作为见面礼物，阿底峡尊者为他触摸了陀螺，用梵文祈求加持、加持和灌顶。 从此以后，特鲁姆·邓巴除了一个月从四面八方筹集资金外，再也没有离开过师傅的身边。 有一次，阿底峡尊者对他说：“我要把所有的佛法都传给你。 钟敦霸说，我没有财力，又是新来的果子，不敢想这种事。 阿底峡尊者圆寂后，受长喀毕琼等藏北人士的邀请，在拉萨河上游建立热钦寺，并逐步形成以热钦寺为祖庭的噶当派。
钟敦巴圆寂后，他的三位著名的**博多瓦、景乌瓦、普奇瓦发扬了他们的教义，并由朗日曾巴、夏日瓦、嘉提卡瓦等传承，信奉噶当巴的寺院遍布西藏数百年，以至于在13世纪，蒙古将军达纳波访问**，并向苦端**报告说，在各个教派中， “噶当巴寺是最多的”。然而，后期最著名的寺院只有前西藏的热真寺和后西藏的纳塘寺。
事实上，在噶当派兴起的同时，西藏时期已经形成了一股宗教力量，那就是宁玛派。 宁玛派是莲花生大士传下来的一个教派。 宁玛派，这是古代的意思，因为僧侣经常戴红色的僧帽，俗称红色宗教。 这个教派以密宗教义为基础，这些教义是由父亲和儿子秘密传承下来的。 正因为如此，即使在朗达玛毁灭佛陀的时期，也没有毁灭性的打击。 早期的宁玛派缺乏系统的理论，很少有代表性的寺院。 有一些咒语大师被称为“阿巴”，他们专门为人念诵咒语，驱邪，祈雨和冰雹，这与苯教没有什么不同。
11世纪，在日喀则以东50公里的雅鲁藏布江南岸，有三位宁玛派大师，名叫苏尔。 他们是大苏尔 （Surchinpo）、他的养子小苏尔 （Surchinwa） 和小苏尔的小儿子 Purpa Shakyasinga。 苏尔的三位祖先代代相传，编纂了过去散落在民间的宁玛派经文，制定了修行大圆满的仪式和规范，并建造了具有代表性的五巴寺。 从那时起，在藏传佛教领域具有影响力的宁玛派就形成了。
在13世纪，这个家族与元朝**建立了联系，释迦维被元朝的祖先忽必烈授予了“八巴什”（法师）的称号。 还有两位宁玛派僧人，永屯多杰贝和桑杰扎，他们长期在元院传授佛法，并获得了丰厚的回报。 宁玛派僧侣齐荣秋吉桑波将大圆满佛法分为三个体系：心、自由和教义。 14世纪的午餐律采巴（1308-1364）是这一传承的领军人物，他写了一本关于七宝的书，详细阐述了宁玛派的教义，成为该派僧侣的必读书。
在苏尔家族努力通过经文传承教义的同时，也有一些宁玛派僧侣非常执着地从石窟和古庙废墟中寻找和挖掘藏族时期的密教经文。 他们相信莲花生大士已经秘密埋葬了许多密教的书面文本，并预言他们将在几年内再次见到曙光。 还有挖掘机的派系，Eniang Nimawise（1124-？）被称为隐宝的上半部分，以古乐楚旺（1212-1272）为代表的隐宝的下半部分被称为下隐宝。许多人对经文的可靠性持怀疑态度，但萨迦班智达后来在湘曲河畔发现了莲花生大士的《性爱金刚》的梵文文本，这种怀疑被打消了不少。 古籍不全是密经，也有历史、医学、美术著作。
16世纪末，后藏拉杜万户首领扎西道杰被日喀则首领新夏派蔡丹多吉击败，失去了领土。 17世纪中叶，宁玛派僧人朱美多吉在雅鲁藏布江中游南岸的扎朗地区兴建了民珠岭寺，传播“藏南”秘法，是魏藏地区宁玛派的根本寺院。 这个教派的主要教义被称为“九乘”：Shravaka、Rim Consciousness和Bodhisattva，统称为三乘：做密宗、行密宗和瑜伽密宗，统称为外三乘，以及大瑜伽密宗、无上瑜伽密宗和至尊瑜伽密宗，称为内三乘。 宁玛派崇拜的神佛众多，其中最具代表性的是八位：文殊菩萨（身）。莲花（语言）、真理（意）、甘露（功德）、金刚（事业），称为“生五部”; 世间也有送异人、咒骂、褒奖，被称为“三部天下”。
在11世纪，坤氏家族产生了一位名叫贡长杰布的杰出人物。 他出生于一个叫“坤氏”的古老家庭，世世代代生活在后藏的中曲江畔。 据说，从西藏国王赤松德赞时代开始，他们就一直在修行和修行宁玛派教义。 有一天，他去附近的一个地方举行仪式，看到许多当地的咒语大师戴着空女人的面具，在人群面前旋转跳跃，表演密宗舞蹈。 他把自己所看到的告诉了在家修炼宁玛派密宗佛教的哥哥坤。 喜悦和真诚。 我哥哥说，现在旧咒语衰落的时候，你应该换新的咒语，我听说芒嘎有一位伟大的翻译，他知识渊博，你应该去找他学习一些新的密宗。
贡长杰布去找卓密译者，跟他学法多年，掌握了他独特的“道果”法门。 然后，Kunchok Jebu在Gui Kubaladze和马仁钦乔的指导下学习。 有一次，他看到中曲河边的卯波山，那里有灰白相间的土地，认为这是一个吉祥的地方，于是他于1073年在这里建造了萨迦北寺，当时贡长杰布只有40岁。 萨迦，意为白土，是寺院的名称。 在萨迦寺的墙壁上，经常使用红、白、蓝三色土壤来装饰它们，象征着三位主，因此萨迦派通常被称为花宗。
昆曲杰布死后，他的长子贡嘎宁波继任寺院院长。 是他使萨迦派真正发展并形成了独特的宗教体系。 贡嘎宁波被尊为“萨钦”（伟大的萨迦上师），是萨迦五位祖师中的第一位。 贡嘎宁波有4个儿子，次子索朗楚玛和三子扎巴坚赞相继继承了法制，被称为二祖和三祖。 63岁时，应成吉思汗孙国端的邀请，萨迦四祖是著名的萨班贡嘎坚赞，他不顾年事已高，体弱多病，毅然北上凉州（武威）达成了向蒙古汗国屈服的协议，蒙古汗国为祖国的统一做出了重要贡献。
萨迦派在佛经方面有两个体系，一个是Yadrup Sangyal传承的体系，另一个是宗喀巴大师的老师Rindarwa Sandrolo传承的体系。 在密教方面，有二、公、高三大宗派，主要传承道国教义。
噶举派的族长是玛尔巴和密勒日巴，关于他们的事迹有许多众所周知的故事。 米拉日巴是后藏公堂（今吉隆）人，父亲成为富商，却英年早逝，留下米拉日巴和母亲被舅舅家欺负。 为了发泄他的口臭，母亲把他送到藏蓉（仁布）的地方学习黑巫术。 据说米拉曾经诅咒过她叔叔的许多家人，并发出冰雹摧毁他们所有的庄稼。 后来，他后悔自己的行为，前往罗扎，在噶当巴祖师玛尔巴的指导下学习佛法，修行佛法，净化邪恶。 起初，玛尔巴并没有教他佛法，而是对他进行各种惩罚性的苦役，比如命令他在高山上建房子，盖了又拆了，拆了又建。密勒日巴忍受了各种精神和肉体的折磨，最后玛尔巴确信他可以成为一个伟大的工具，并把他所掌握的所有密宗教义传授给他。
完成学业后，密勒日巴回到家乡贡塘、尼亚兰，在深山洞窟中继续修炼，以苦行著称，甚至只靠泉水和野草为生。 他最擅长的是“笨拙的火”，冬天只穿一件布大衣御寒，所以他被称为米拉日巴，意为“穿布的米拉”。 密勒日巴经常唱布道教育百姓，歌词哀叹百姓的苦难，揭露世人的不公。 他有很多男人和女人，最著名的是 Rejongba 和 Tabraj。 热宗巴长期在山南的亚龙、龙子一带传教，并建立了许多禅修洞和寺院。 塔布拉杰在塔布（今山南地区嘎查县）建立了岗布寺，在那里他教弟子并传授佛法。 他将噶当巴学派的教义与密宗密宗的教义融合在一起，形成了一个基于大手印的体系，称为禁忌噶举。
塔布噶举派还报告了四个主要分支和八个小分支。 四大分支分别是以中部寺（德清县）为祖庙的噶玛噶举派，以蔡寺、公堂寺为祖庙的蔡巴噶举派，以安仁巴荣寺为祖庙的八戎噶举派，以敦萨寺（桑格里县）为祖庙的巴珠噶举派。帕朱噶举有八个小分支，分别是以直贡提寺（Mozhugongka）为祖庙的直贡噶举派，以达隆寺（林周）为祖庙的达隆噶举派，以仁龙寺（江孜）为祖庙的巴噶举派，以亚山寺（内东）为祖庙的雅山噶举派， 以旭浦寺（日喀则）为祖庙的绥普噶举派，以蜀斋寺（曲水）为祖庙的修赛噶举派，以耶普寺（大子）为祖庙的耶巴噶举派。四大分支的噶玛噶举派、直贡噶举派、塔隆噶举派、八小支部的朱巴噶举派仍然活跃在各地，其余的部落在漫长的历史中逐渐消亡。