圣源广通基因测序实验室管理系统覆盖基因测序的全程生成,旨在提高实验效率,确保数据质量和信息符合相关质量管理标准或规范。 通过对系统各环节的严格管理,检测过程管理实现了订单生成管理、样本接收、任务分配、双盲录入、样品申请、结果录入、质量控制管理、数据管理等,解决方案已应用于多家第三方检测实验室、分子精准医学检测中心、特检实验室、医院等机构, 并不断迭代和更新,以满足不同客户的需求。
系统优势:信息交换。
系统需要能够接收来自不同测序设备的数据,并将其存储在统一的数据库中,以确保数据的完整性和可访问性。 确保数据的一致性和标准化对于不同系统之间的信息交换至关重要。
质量管理。 确保实验室操作流程规范化、规范化,包括样品处理、实验操作、数据采集和存储等。 建立质量控制标准和指标,以监控实验室内每个阶段的数据质量。
可追溯性数据。 记录数据处理和分析的所有步骤,包括使用的软件工具、分析算法和参数设置,以确保可重复性和透明度。 记录数据生成的各个环节,包括测序仪器型号、实验操作符、测序参数、时间戳等信息。
安全稳定。 在数据传输和存储方面,采用强大的加密技术,确保数据安全。 这包括提高数据处理和存储效率,以确保系统的高效稳定运行。
智能解读。 快速分析和解释基因测序数据,使用机器习模型对大量已知数据进行训练,以识别和识别特定遗传变异与疾病或生理特征之间的关联。
配备智能硬件。
这些仪器能够对大规模基因组进行快速准确的测序。 其高速、高通量特性可显著提高实验室产量。 通过整合来自多个实验室设备和系统的信息来提供统一的控制界面,从而简化实验工作流程。
核心功能:
检测订单管理:客户可以通过系统填写个人信息,创建排序管理系统账号,个人登录账号可填写订单并上传。 系统可以记录有关订单客户的信息,有关样品的信息,实验要求和特殊要求。 订单发出后,客户可以实时查询订单的排序进度、排序明细、结果报告,支持客户的单次或批量订单结果。 如果实验室订单全过程出现异常,可以通过电子邮件或客户留言通知客户。
任务分配:实验室工作人员可以将样品处理、测序操作、数据分析等各种任务注册到系统中。 然后将任务分配给相应的员工或实验组,确保每个任务都有所有者。 允许您确定不同任务的优先级,以确保可以更快地处理紧急任务。 根据任务的紧迫性和重要性自动调整任务分配和资源分配。 提供实时任务状态监控,查看任务进度,识别和解决可能的延迟或问题。 根据系统规则和实验室工作流程,自动将任务分配给合适的人员或设备。 能够智能调度实验室内的资源,包括设备、仪器和人员,以优化任务执行效率。 内置的通信工具促进了实验室内团队之间的协作和沟通。 您可以在系统中留言和共享文件。 工作人员可以确认任务的完成情况,并在系统中更新任务的状态。
工作流管理:客户提交样品的信息管理,包括样品基本信息、样品交付时间、样品**、测试项目、测试报告时间等。 将样品收到并检查无异常后的样品信息录入检测业务系统,并通过相关消息服务及时通知检测人员进行检测,并将相关检测结果录入系统并提交下一步验证。 测试结束后,将相关测试过程数据发送给测试验证人员进行测试数据验证。 测试数据和过程数据通过审核后,将进行后续的测试报告打印和审核阶段,获得批准后,即可打印相关测试报告。 测试报告审核通过后,将相关测试报告打印出来并交付给客户,并结算报告打印次数和测试业务。
样品接收:
1.每个样品都经过登记,包括样品的**、标识、类型等信息,确保样品的唯一性和可追溯性。 实验室工作人员根据订单的要求接收样品,并进行初步的质量控制,例如检查样品的数量、外观和保存情况。
2.对收到的样本进行处理,包括提取、文库制备、测序等步骤。
3.存储和管理的样品进行存储,包括样品的存储位置、温度和湿度等环境条件的控制以及样品出入库的管理。
4.该系统允许实验室工作人员登记收到的每个样本,包括样本**、采集日期、采集者等信息。 为样品引入唯一标识符(例如条形码或 RFID),以确保在整个过程中跟踪和识别样品。
5.提供实时样品跟踪,使实验室管理人员能够随时了解每个样品的当前状态和位置。 将样品分配到适当的实验组或设备,以保证实验室资源的合理分配。 支持根据实验需求和样品特性进行自动分液。
6.提供样品保存信息,包括保存位置、保存条件等,确保样品保存质量。 允许实验室人员更新样品信息,例如修改样品状态、添加其他信息等。 提供权限控制,确保只有授权人员才能修改样品信息。
7.自动向相关人员发送通知,提醒他们有新样品已到达或需要处理。
双盲进入:当样本被输入系统时,可能需要以匿名或编码的方式对其进行识别,以防止研究人员知道样本的身份。 系统应提供保证双盲的识别方法,例如使用不相关的独立代码或随机生成的样本标签。 录入测序数据、实验结果等数据的过程也应采用双盲。 该系统可以在数据输入阶段使用匿名编码,仅在分析和解释阶段揭示样品的真实身份。 限制实验室工作人员对关键信息的访问,以确保只有特定的研究人员才能解释或分析双盲数据。 记录每个条目和访问的信息,以便您可以跟踪数据的处理历史记录。 提供盲审功能,允许独立审稿人对数据进行审核,确保实验过程的透明度和质量。 实验完成后,系统可以生成双盲报告供研究人员分析,同时隐藏相关身份信息。 确保报告不包含可能泄露样本身份的信息。
来样加工:根据实验需要,准备适量的样品,并进行必要的预处理,以保证样品的质量和可操作性。 提取的DNA RNA经过处理进行文库处理,即通过添加测序接头、PCR扩增等步骤,将DNA RNA转化为可测序的文库。 对文库质量进行评价,包括对文库浓度和特异性的检测,确保文库的质量和稳定性。 文库在计算机上测序,一般采用高通量测序技术对测序数据进行处理和分析,包括序列比对、突变检测、基因注释等步骤,最终得到基因序列数据及相关分析结果。
质量控制管理:根据不同的基因检测项目,设计相应的质控产品,包括质控品的种类、浓度、稳定性等指标的测定。 对处理后的控件进行测试,包括排序、数据分析和其他步骤,以确保控件的准确性和稳定性。 对质量控制进行全面管理,包括储存、使用、报废等环节,确保质量控制的质量和可追溯性。 对基因测序实验的全过程进行质量控制,包括样本制备、核酸提取、文库构建、测序、数据处理和分析等,确保实验数据的准确性和可靠性。 定期评估基因测序实验室管理系统的质量,包括评估系统的稳定性、准确性和可重复性,以确保系统的高质量运行。
数据分析:检查数据质量,包括测序质量得分、测序错误率、测序深度和覆盖率等指标,以排除可能的测序错误和质量问题。 对原始数据进行预处理,包括删除低质量读取、删除适配器序列、删除污染序列等。 根据研究目标,对获得的数据进行进一步分析,如关联分析(GWAS)、疾病分类、模型构建等。
测试报告:(报告审批、报告发布、报告归档等) 根据不同的基因检测项目和客户需求,整合实验过程中产生的所有数据,包括样本信息、测序数据、突变体检测结果等,设计相应的报告模板,包括报告格式、内容、版面等。 根据模板和数据,自动生成检测报告,包括样本基本信息、测序结果、变异检测结果等。 对生成的报告进行审核,检查报告的准确性、完整性和标准化,确保报告的质量和可靠性。
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