哈维·阿隆索作为托尼·克罗斯的替代者来到拜仁，但他细腻的脚下技术和出色的组织能力立即给拜仁球迷留下了深刻的印象。 在时任拜仁主帅瓜迪奥拉的带领下，阿隆索迎来了职业生涯的第二个春天，将他仅存的热情发挥到极致，成为当时拜仁新的中场核心和领袖之一。
阿隆索在家乡俱乐部皇家社会首次亮相，在那里他花了五个赛季将一个降级区变成了西甲强队。 阿隆索在2004年以1500万英镑的价格从皇家社会被利物浦签下，并在2005年欧冠决赛对阵AC米兰的比赛中为利物浦打进了决定性的进球，完成了惊人的复出。 最终，利物浦通过点球大战以总比分6-5击败AC米兰，时隔21年再次夺得欧冠冠军。 第二年，阿隆索依旧状态出色，帮助利物浦夺得足总杯冠军。 阿隆索于2009年以3000万欧元的转会费加盟皇家马德里，在此期间，他赢得了2011年西班牙国王杯和2011-12赛季西甲冠军。 在2013-14赛季，阿隆索帮助皇家马德里赢得了国王杯和冠军联赛，阿隆索在2005年再次加冕后赢得了冠军。
阿隆索于2014年正式加盟拜仁慕尼黑。 2014-15赛季，阿隆索在德甲联赛中出场29次，成为拜仁中场不可或缺的球员。 阿隆索本赛季场均触球138次，其中在拜仁客场2-0战胜科隆的联赛第六轮比赛中触球213次，创造了自1999年德甲有数据以来的新纪录，而阿隆索70%的长传成功率让阿隆索能够从后场调度球队的进攻方向。 在接下来的两个赛季里，阿隆索的表现越来越强，拜仁年复一年地夺得冠军。 拜仁在2016-17赛季德甲最后一轮主场4-1击败弗赖堡，这场比赛也是阿隆索职业生涯的最后一场比赛。 在拜仁效力期间，阿隆索赢得了三个德甲冠军，一个德国杯冠军和一个德国超级杯冠军。
阿隆索的国家队生涯比他的俱乐部更顺利。 阿隆索在2003年首次被征召到西班牙。 在2008年欧洲杯上，阿隆索随队，最终帮助西班牙赢得了德劳内杯。 在2010年世界杯上，阿隆索以西班牙1-0战胜荷兰队，赢得了球队历史上的第一个大力神杯。 在2012年欧洲杯决赛中，阿隆索凭借出色的表现帮助球队4-0击败意大利队，卫冕欧洲杯冠军。 2014年，阿隆索宣布从西班牙国家队退役，在他的整个国家队生涯中，阿隆索一共为西班牙队出战了114场比赛，打进16球，帮助西班牙连续三届夺得重大赛事冠军，是西班牙王朝的重要奠基人之一。