陕甘归叛，刘金堂炮击金鸡堡，马化龙再次投降

经过与清军漫长而英勇的消耗战，马化龙的犯罪金鸡堡基地终于耗尽了粮食储备。 到1870年9月，刘金堂只攻占了金鸡堡周围500多个碉堡中的十几个。 为了加强进攻，刘金堂从上海运来了从德国进口的克虏伯攻城炮，并装备了一批经验丰富的炮手军官。 虽然炮弹未能炸穿据说有35英尺厚的金鸡堡城墙，但刘金堂任在10月建立了一个炮兵阵地，并成功地将炮弹发射到城里。

金鸡堡的叛军处于绝境，依靠基层和死者遗骸养活自己。 在难以忍受的困境中，马化龙于1月向刘金堂投降，交出了46门山炮、293门土炮、1030支霰弹枪和180门外国枪。 左宗棠暂时搁置了对马化龙的处决，希望他能说服其他甘肃回族投降。 然而，没有一个重要的酋长愿意出来投降。

当清军发现金鸡堡藏匿的1200多支洋枪时，左宗堂怒吼令凌迟处死马化龙及其成年男性亲属。 大约800名叛军参谋和军官以及1 000名士兵被处决。 140,000名身体健全的居民，包括多达110,000名来自陕西的回族人，被搬迁到平凉附近。 20,000名叛乱分子的家属被送往甘肃南部的难民营。 清军获准掠夺要塞内的财物。 与此同时，1869年向刘嵩山投降的汉族后裔陕北掠夺者，在左宗堂的怂恿下，带着家人到金鸡堡定居，把金鸡堡改造成汉族城镇。