非靶向蛋白质组学旨在全面分析生物样品中的所有蛋白质，而不是专注于特定蛋白质，有助于研究蛋白质组的复杂性并发现新的蛋白质标记物。 蛋白质测序是确定蛋白质氨基酸序列的过程。 它是生物学研究中了解蛋白质结构和功能以及研究与蛋白质相关的生物过程的重要技术。 非靶向蛋白质测序是一种全面的蛋白质组学方法，旨在分析生物样品中的所有蛋白质，而不是选择性地确定感兴趣的特定蛋白质。 这种方法也称为鸟枪法蛋白质组学。
非靶标蛋白质组测序的特点
1.覆盖范围广：尝试识别样品中所有可检测的蛋白质，而不仅仅是一组特定的蛋白质。 2.以发现为导向：这种方法适用于探索性研究，其目标不是测试特定的假设，而是发现新的模式、连接或蛋白质功能。 非靶标蛋白质组测序的一般步骤包括：
1.样品制备：
从生物样品中提取蛋白质并进行适当处理，例如蛋白质降解、还原和烷基化。
2.液相色谱质谱分析
使用液相色谱质谱 （LC-MS） 通过质谱分离和测定蛋白质样品。 这使得样品中的蛋白质可以被分成许多片段，可用于鉴定和定量。
图1非靶向蛋白质组学。
3. 数据分析
将质谱数据与数据库中已知的蛋白质序列对齐，以鉴定样品中存在的蛋白质。 此外，未知蛋白质的分析方法也可用于鉴定新蛋白质。
4. 定量分析
通过质谱信号的强度对每种鉴定的蛋白质进行量化，以了解它们在样品中的相对丰度。
5. 生物信息学分析
将鉴定和定量的蛋白质与有关生物学功能、通路和代谢网络的相关信息相关联，以获得对样品的更多生物学见解。
应用领域
1.生物标志物发现：非靶向蛋白质组学可用于在疾病诊断和药物反应监测等领域发现新的生物标志物。 2.疾病机制研究：通过比较健康和疾病状态下组织或细胞的蛋白质组，可以帮助了解疾病的分子机制。 3.作用机制：探讨药物治疗对细胞蛋白质组的影响，揭示药物的分子靶点和作用机制。 4.系统生物学研究：在系统生物学中，非靶向蛋白质组学有助于在细胞和组织中建立蛋白质网络，以了解复杂的生物过程。