土地增值税清算是指房地产开发企业对符合清算条件的项目，依照法律、行政法规和有关政策对土地增值税进行清算，并按照规定向税务机关申报缴纳土地增值税的过程。
1. 清算条件。
1.房地产开发项目已全部建成并出售;
2.开发项目已取得《建设项目竣工验收备案表》;
3.房地产开发企业已完成税务登记，取得税务登记证;
4.房地产开发企业取得《土地使用权证书》;
5.房地产开发企业取得《建设用地规划许可证》和《建设工程规划许可证》;
6.项目投资的50%以上已由房地产开发企业完成;
7.房地产开发企业已取得《预售许可证》，并签订了《商品房预售合同》。
2. 清算流程
1.确定清算时间：房地产开发企业应当自满足清算条件之日起90日内向当地主管税务机关申报缴纳增值税。
2.编制清算报告：房地产开发企业应当按照国家税务总局制定的清算报告编制清算报告，包括《土地增值税清算表》和《土地增值税清算时间表》。
3.提交清算信息：房地产开发企业应当向主管税务机关提交下列清算材料：
1）房地产开发企业营业执照复印件及复印件;
2）《土地使用权证明》、《建设用地规划许可证》、《建设工程规划许可证》、《建设工程施工许可证》、《商品房预售许可证》等相关证明文件复印件;
3）土地增值税清算报表及相关材料;
4）房地产开发项目的会计账簿和凭证;
（五）主管税务机关要求的其他材料。
4.清算信息审查：主管税务机关应当对房地产开发企业提供的清算材料进行审查，包括清算报告的完整性、合规性和准确性。
5.确定征税依据：主管税务机关根据审计结果确定房地产开发企业的计税依据，包括项目收入、工程造价、相关税费等。
6.计算应缴税款：主管税务机关按照确定的税费计算依据计算房地产开发企业应缴纳的增值税金额。
7.缴纳税款：房地产开发企业应当按照主管税务机关核定的税额向主管税务机关缴纳增值税。
8.取得完税证明房地产开发企业缴纳土地增值税后，应当向主管税务机关取得纳税证明作为纳税凭证。
9.归档：房地产开发企业应将清算过程中产生的所有文件和资料归档保存，以供主管税务机关核实。
3. 注意事项。
1.房地产开发企业应当认真履行土地增值税清算义务，确保清算的准确性和合规性。
2.主管税务机关应当对房地产开发企业的清算情况进行监督检查，确保按时缴纳和合规征收税款。