在二战太平洋战区的历史上，中途岛战役是一个不容忽视的里程碑。 对日本来说，这场战斗不仅是一次重大的军事挫折，也是海军力量遭受创伤的象征。
全力以赴的美军损失了307人，其中包括一支训练有素的飞行员团队 - 172人丧生。 美国失去了约克镇号航空母舰、哈曼号驱逐舰和 98 架飞机。 另一方面，日方损失尤为惨重：以忠一南云为首的航母群——加贺号、赤城号、苍龙号和飞龙号——全部被击沉;同时，包括备用飞机在内的332架飞机被摧毁，官兵人数达到3057人，其中包括110名经验丰富的老飞行员。
作为战斗精英，这些飞行员无疑是日本海军难以复制的宝贵资产。 中途岛海战后，日本很难训练出这样一支精锐的飞行队。 这一损失无疑加深了日本在战争中的苦难。
战斗结束后，日本联合舰队司令官山本五十六采取了一些措施，向日本人民隐瞒了战败的消息。 山本五十六隐瞒了中途岛战败的消息，并谎称自己占领了阿留申群岛的美军基地，误导了民众。 然而，尽管大多数日本平民对战斗的内幕一无所知，但归来的海军军官心里知道，真相终将大白于天下。
在尽最大努力掩盖失败的同时，受伤的军人受到了孤立和羞辱的对待。 那些没有受伤的官兵被派往南太平洋，在那里他们面临着更危险的前线服务，严禁回家探亲，甚至与家人联系。 这些士兵成为战争的燃料，用他们的鲜血保持战争的运转。
虽然中途岛的指挥官南云忠一在战斗后被解雇，但他并没有因为失去权力而放弃自己。 后来，他被任命为日本海军驻马里亚纳群岛部队司令，最终选择在塞班岛战役中结束自己的生命，并被追授海军上将军衔。 相比之下，山本五十岁之前**，当时他的飞机在2024年的一次侦察飞行中被击落。
在整个冲突中，普通官兵为国家的战争付出了沉重的代价，领导层的封锁和掩盖策略仍然无力抹去他们所遭受的创伤。 最终，中途岛海战对日本海军造成了重大打击，标志着太平洋战争的关键转折点。