MIMIC数据提取教程:患者入住ICU后如何提取第一个WBC和SpO2值

小夏 科技 更新 2024-01-31

要阅读本文,建议先阅读本文,其中对相关的SQL基础知识进行了说明。

MIMIC 数据提取教程 - 从首次入住 ICU 的患者中提取数据。

一般来说,我们并不关心患者的所有临床指标,所以让我们更具体一点,比如:患者入住ICU后,如何提取第一个WBC和SPO2值。

WBC:白细胞,对应项目编号 51300、51301

SPO2:血氧饱和度 脉搏血氧饱和度对应于 itemid 646 和 220277

涉及三个**:

1. ICUSTAY记录所有入住ICU的患者的身份证、入住ICU的时间和离开ICU的时间。

2. LabEvents 记录了所有患者的实验室检查,包括未入住 ICU 的患者。

3. ChartEvents 记录了所有 ICU 患者的生命体征。

目标是:都活着icu病人因此,基于icustay表中记录的数据,三个**的共同值是受试者ID(每个患者的唯一编号),从而将三个表链接起来。

如图所示,对应同一个ICU记录STAY ID(30000153),该患者有很多白细胞记录,这里我们按时间对它们进行排序。

因此,让我们添加一列序列号。 然后让我们选择第一个。

也就是说,将当前结果另存为临时表,然后对其进行筛选。

您可以对 SPO2 执行相同的操作,只需将 labevents 表替换为 chartevents,最后将两个表联接起来即可。

跟随***包括科学研究发送"WBC 和 SPO2"获取完整的**。

在 n**icat 中,检索结果后会出现一个导出结果按钮。

ps:有同学说**的n**icat不好用,后台回复"n**icat"通过安装教程获取破解版。

支持导出不同的格式。

另外,很多人在导出到Excel时都会遇到这样的错误,其实是因为Excel只支持65535行。 新冠刚出来的时候,不是有消息说英国疾控部门用excel统计新冠患者数据,因为超过65535行的限制导致患者漏统计吗?所以导出 CSV 或其他格式不会有这个问题。

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