所谓司令部，主要负责军队的战术指导、战场协调、战略决策至于“总参谋部”，它在军事层面被赋予了更多的任务，特别是在处理复杂的军事问题方面。 军改将司令部改组为总参谋部，初衷是为了更好地适应现代战争的新形式、新趋势，提高我军实战能力。
以联合参谋部的成立为例，作为团级以上作战部队的参谋单位，其负责人仍称为参谋长，虽然职称不变，但实际上已经从部门负责人晋升为实质意义上的作战单位高级领导， 主要负责协助军事指挥员进行全方位的作战准备、组织指挥等重要工作。在这次焕然一新的军队改革中，总参谋部的新职责包括安全保障、教育训练、军事研究、情报信息收集分析等多项任务，这些任务都关系到军队的整体战斗力和国家的国防安全。
同时，我们不能忽视其他非战斗军事单位，它们也有相应的参谋部，有参谋长。 比如过去总后勤部和第一预备队部经常被误以为只负责地方部队需要的物资，但实际上他们也有自己相应的部队，比如武汉后方基地、卫星发射中心等。 原有附属单位撤销后，总后勤和**的指挥水平明显降低。 有趣的是，这些部队的大多数参谋长都是正规军军衔，而不是过去在部门担任副手的角色。
军事改革的另一个重要变化发生在我国的军事院校。 本来，承担战斗任务的部队没有一个参谋部，但在44个军事院校中，有6个已经作为特殊存在而出现，他们不仅有参谋部，甚至还选择设立参谋长，这些军事院校的名称是： 陆军航空学院、海军航空航天大学、空军航空大学、空军哈尔滨飞行学院、空军石家庄飞行学校、空军习飞行学校。显然，这六所军校的鲜明特点在于与航空飞行的紧密联系，致力于为空军、陆军航空兵和海军航空兵提供优秀的空军人才。
飞行员这样超然、特殊的职业属性要求极其严格的人员选拔标准、极其漫长的培训周期、持续的资源投入，尤其要求培训体系达到最高标准。 这六所军事院校和副军级院校、行政级院校，是这条高效精准的飞行员训练路线的关键起点，追求战斗教学质量，树立了为战斗而教育人的理念，他们负责着“教学、 训练、科研“，甚至会设立训练基地、训练旅、训练团等训练单位，这种内脏分工与作战部队无异，还设立了庞大的参谋部，其负责人的岗位仍是参谋长。