近日,中国农业科学院郑州果树研究所草莓种质改良团队、深圳市农业基因组研究所联合发布了八倍体草莓端粒-端粒基因组,系统分析了八倍体草莓亚基因组的结构和遗传分化,分析了该亚基因组的表观遗传进化机制。 研究结果发表在《园艺研究》上。
记者了解到,该研究以红岩草莓为材料,从头将八倍体草莓端粒组装到端粒基因组中,共鉴定出ABCD的4个亚基因组等109320个基因。 通过构建系统发育树,发现B、C、D亚基因组是第一个被引入八倍体基因组的亚基因组,A亚基因组是最后一个直接祖先供体。
分析表明,亚基因组A的CG、CHG和CHH甲基化水平最低。 亚基因组A的偏向表达基因高于其他亚基因组,且A偏向表达的同源基因大多为基因体甲基化(GBM)。 本研究为草莓基因功能挖掘、抗性分子育种和品质改良的后续开发提供了理论和数据支撑。
该研究得到了国家重点研发计划、中国农业科学院科技创新项目和河南省重大科技专项的支持。
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