gerdh
花多组学数据库。
楼盘名称：GERDH： 花卉多组学数据库链接：项目简介：GERDH包含来自150多种园艺花卉植物种质的12,961种观赏植物。 对比不同花卉植物的转录组学、表观基因组学等数据，通过交互式分析快速挖掘关键功能基因。 该数据库还提供基因表达、种内分析、表观遗传调控、基因共表达、富集途径和系统发育分析等功能模块。 合作：南京农业大学cite：gerdh: an interactive multi-omics database for cross-species data mining in horticultural crops.plant journal,2023.
gourdbase
多组学葫芦数据库。
楼盘名称：GourdBase：以基因组为中心的多组学葫芦数据库链接：项目简介：Gourdbase以基因组数据为中心，整合表型、标记、QTL、遗传图谱、品种等相关数据信息。 直观、内联和内联的数据平台可帮助研究人员更好地浏览、搜索和访问感兴趣的信息，从而加速他们的研究。 合作：浙江省农业科学院蔬菜研究所.
cite：gourdbase: a genome-centered multi-omics database for the bottle gourd (lagenaria siceraria), an economically important cucurbit crop.scientific reports,2018.
cucume
葫芦科物种RNA甲基化数据库。
楼盘名称：Cucume：整合系统性mRNA信号转导、GWAS和QTL遗传调控以及葫芦科不同组织中表观遗传学的RNA甲基化数据库
链接：
项目简介：在全基因组水平上鉴定了南瓜和黄瓜中含有 5-甲基胞嘧啶 （M5C） 和 N6-甲基腺苷 （M6A） 位点的 mRNA。 利用黄瓜南瓜异种移植物研究中发现的移植物传播性全身性mRNA，进一步整合黄瓜全基因组关联分析（GWAS）和数量性状位点（QTL）可用于研究与葫芦RNA甲基化相关的遗传和表观遗传调控。
合作：中国农业大学蔬菜作物生长发育调控北京市重点实验室.
cite：cucume: an rna methylation database integrating systemic mrnas signals, gwas and qtl genetic regulation and epigenetics in different tissues of cucurbitaceae.comput struct biotechnol j,2023.
imarmot
土拨鼠比较基因组数据库。
项目名称：土拨鼠：土拨鼠比较和功能基因组学的综合平台链接：
项目简介：该数据库包含14种土拨鼠的生物学信息、6种土拨鼠的基因组序列、3种土拨鼠的同源关系和直系同源物，以及几种冬眠动物和鼠疫宿主的表达谱。 与一组分析和可视化工具集成，例如 Kegg 或 Go 富集分析、PCA、BLAST、肌肉、genewise、LATZ 和 jBrowse。 该数据库还提供了一个DEGS（差异表达基因）模块，用于可视化冬眠者和瘟疫宿主的基因表达变化。
合作：习交通大学基础医学院.
cite：imarmot: an integrative platform for comparative and functional genomics of marmots.bmc genomics,2020.
modb
软体动物线粒体基因组数据库。
楼盘名称：MODB：软体动物线粒体基因组的综合数据库链接：项目简介：该数据库致力于收集、组织和共享有关软体动物线粒体基因组的信息。 与一系列分析和可视化工具集成，例如 BLAST、Muscle、Genewise 和 LASTR。 它为有兴趣了解软体动物生物学特征的研究人员提供了一个全面的信息和分析平台合作：烟台大学cite：modb: a comprehensive mitochondrial genome database for mollusca.database,2021.
myrica rubradatabase
杨梅多组学数据库。
楼盘名称：杨梅数据库：杨梅的多组学数据库链接：
项目简介：杨梅数据库是一个智能、交互式和用户友好的系统，使研究人员、育种者和园艺师能够浏览、搜索和检索相关和有用的信息，以促进杨梅的基因组研究和育种工作。
合作：浙江省农业科学院园艺研究所.
cite：the bayberry database: a multiomic database for myrica rubra, an important fruit tree with medicinal value.bmc plant biology,2021.
ogda
藻类的综合细胞器基因组数据库。
楼盘名称：OGDA：藻类的综合细胞器基因组数据库链接：
项目简介：OGDA 数据库包含 1055 个质体基因组和 755 个线粒体基因组。 该数据库还集成了各种应用程序，用于分析藻类细胞器基因组的结构表征、共线性和系统发育。
合作：中国海洋大学海洋生命科学学院.
cite：ogda: a comprehensive organelle genome database for algae.database,2020.
hugedomains
水稻泛基因组数据库。
项目名称：33种遗传多样性水稻种质的泛基因组分析揭示隐藏的基因组变异链接：
项目简介：该研究提供了一个泛基因组规模的基因组资源，提供了对水稻基因组变异数据库的访问，包括171,072个SV和25,549个GCNv，并使用Oryza glaberrima组装来推断水稻群体中SV的衍生状态。
合作：四川农业大学.
cite：pan-genome analysis based on 33 high-quality assemblies provides insights into hidden genomic variations in rice.cell,2021
macadamiaggd
澳洲坚果种质资源和功能基因组学的综合平台。
楼盘名称：澳洲坚果：澳洲坚果种质资源和功能基因组学的综合平台链接：
项目简介：该数据库是简单序列重复SSR标记的宝贵集合，包括本研究中开发的基于澳洲坚果基因组序列的标记和先前开发的标记。 Macadamiaggd 还集成了多种生物信息学工具，如搜索、jbrowse、blast、引物设计器、序列提取、富集分析、多序列比对、基因组比对和基因同源注释。
合作：广西大学.
cite：macadamia germplasm and genomic database (macadamiaggd): a comprehensive platform for germplasm innovation and functional genomics in macadamia.frontiers in plant science,2022.
arctium
牛蒡多组学数据库。
项目名称：牛蒡数据库：牛蒡（一种食品和药用植物）的多组学数据库链接：
项目简介：该数据库包含十个核心功能模块：Home、Genome、Transcriptome、JBrow、Search、Tools、SRAP Fingerprint、Related Microbiology、Chemistry和Publications，该数据库整合了分子和化学数据，为感兴趣的研究人员提供了一个全面的信息和分析平台，对牛蒡的栽培、育种和分子生药学研究有很大帮助。
合作：辽宁中医药大学药学院.
cite：the burdock database: a multi-omic database for arctium lappa, a food and medicinal plant.bmc plant biology,2023.